根据国税发[1996]107号文件规定：对试行年薪制的企业经营者取得的工资、薪金所得应纳税款，可以实行按年计算、分月预缴的方式计征，即企业经营者按月领取的基本收入，应在减除800元的费用后，合计其全年基本收入和效益收入，按12个月平均计算出每月应纳的税款，再乘以12，计算出全年应纳税款，年终汇算清缴，多退少补。计算公式：
应纳税款=[（全年基本收入和效益收入/12-费用扣除标准）×适用税率－速算扣除数]×12。
　　例：北京市某公司经理每月取得工资薪金收入2000元，年终取得效益收入96000元，单位应代扣代缴经理的个人所得税为：
　　（1） 每月应预缴税款=（2000-1000）×10%-25=75（元）
　　（2） 全年已预缴税款=75×12=900（元）
　　（3） 全年收入=2000×12+96000=120000（元）
　　（4） 月平均应纳税额=（120000/12－1000）×20%－375=1425（元）
　　（5） 全年应纳税额=1425×12=17100（元）
　　（6） 全年应补缴税款=17100－900=16200（元）